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aminoXpressv7.7.0.0官方版

aminoXpressv7.7.0.0官方版

类型:教育教学 语言:英文

大小:2.8M 更新时间:2020-07-06

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应用简介


aminoXpress是一款专为生化行业设计的CAD应用软件,能够实用地处理用户复杂的生化问题。它是一款功能丰富、实用的多功能生化包集成。









aminoXpress是一款专为生化行业设计的CAD应用软件,能够实用地处理用户复杂的生化问题。它是一款功能丰富、实用的多功能生化包集成。



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基本介绍



aminoXpress 集成了生物化学家每天执行的常见功能。除了传统的序列输入协议之外,该程序还提供了一种新的协议,用于通过构建块和相应的计数来输入序列。这为程序处理非常复杂、分支、循环和冗长的序列提供了可能性。该程序还通过其用户可定义的片段数据库将其范围扩展到一般有机化学。



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特征



1. 氨基酸分析:该模块针对氨基酸分析结果计算最佳残基比。通过将水解过程中容易氧化的残留物输入“未优化残留物”部分,可以将对优化结果的影响降至最低。



2. 复合构件组成:该模块根据构件(氨基酸、片段)具有离散权重值的事实来识别意外产品的身份。在扫描它们的组合后,偏差最小的组合更有可能是导数。



3. 消化模式:该模块通过用户定义的酶或化学模式预测消化产物。



元素分析:该模块计算序列中不同元素的理论百分比。通过进一步输入每种元素的实验百分比组成,可以确定其经验公式和/或其聚集体。



4. 碎裂:该模块预测由三种类型的键断裂产生的质谱碎裂:一氧化碳/一氧化碳、一氧化碳/碳氢化合物和碳氢化合物/碳氢化合物。生成的片段可以直接导入质量模块并用于模拟质量分布模式。



5. 螺旋轮/网:该模块显示并操作螺旋结构的顺序轮/网显示。



6.同位素分布图:该模块预测输入公式或序列的同位素分布图,电荷变化或模式为1到3



7. Lib组合文库:该模块预测1-3个电荷的OR模式下的组合文库(如肽文库)的质谱。直到最后一步才进行质量舍入,以确保准确性。此外,该模块将其预测能力扩展到有机文库:随机变体可以是氨基酸、片段或两者。结果还包括横截面残差的随机组合



8.主题发现:该模块通过模式识别预测序列中潜在的药物活性位点。它有助于扫描预设或随机重复的模式、潜在的药效基团以及表现出相同生物活性的加载序列。



9. 分子量:该模块计算肽和蛋白质的分子量。输入可以通过传统的序列方案或通过氨基酸和片段等构建块。替代方案使模块能够计算复杂分子的分子量,例如带有保护基团的肽、肽模拟物、长链和支链分子等。原子量的进一步使用通常会扩展模块计算任何化合物的分子量的能力。



辅助说明



10.数据库数据库管理:该辅助模块允许用户管理本程序中使用的所有数据库,例如氨基酸数据库、片段附件数据库.等。开放式设计允许用户根据自己的具体项目定制数据库。



11、序列序列加载器:该辅助模块允许用户将序列加载并解析到相应模块的入口部分。专家系统自动识别侧链、环状结构、虚假取代和额外加合物等特性。