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Discovery Studio(化学实验软件)v4.5免费版

Discovery Studio(化学实验软件)v4.5免费版

类型:教育教学 语言:英文

大小:526.7M 更新时间:2021-07-29

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应用简介


Discovery Studio是一款专业的化学实验软件,可以帮助用户创建分子模型,以便更好地进行分析。它可以可视化复杂的化学数据并导入数据为您生成相关模型。









Discovery Studio是一款专业的化学实验软件,可以帮助用户创建分子模型,以便更好地进行分析。它可以可视化复杂的化学数据并导入数据为您生成相关模型。



Discovery  Studio(化学实验软件)



特征



1、基本界面及显示模块



1.Discovery Studio独立版



可视化界面是使用Discovery Studio软件破解版进行分子设计和模拟的基础,并支持安装在同一台机器上的服务器-客户端操作模式。与Pipeline Pilot Server结合,提供化学/生物数据显示、模拟/分析、3D分子构建、动态变化显示、3D绘图等多项功能



2.Discovery Studio Visualizer 客户端



它是服务器-客户端操作模式下客户端的可视化界面,用于访问和使用服务器端软件。必须与服务器端配置的Pipeline Pilot Server配合使用,为用户提供无与伦比的数据、工作流程和计算资源共享



2. 蛋白质模拟模块



1.DS建模器



只要将一个未知的结构序列与另一个已知的三维结构蛋白进行比对,利用行业标准的快速同源建模方法就可以自动快速生成优化的蛋白同源模型。对于靶标发现和蛋白质家族功能结构分析,MODELER 是理想的解决方案。 MODELER 还可用于模拟蛋白质突变、进行环区域建模和基于结构的比较,以及构建具有配体结合的蛋白质结构模型。与序列分析模块相结合,抗体环区域建模可以完全自动化。结合软件中模拟和基于结构的药物设计的功能模块,MODELER还可以用于深入研究蛋白质结构与功能的关系。



2.DS蛋白精炼



使用CHARMm对建模蛋白质的侧链和环区域进行优化,以提高蛋白质模型的准确性。



3. DS 蛋白质健康



蛋白质三维结构合理性评价工具。 Protein Health模块采用Profiles 3D方法,通过将三维结构的结构环境与特定氨基酸残基优先的外部环境进行比较,获得相关结构特性与氨基酸序列信息之间的关系。通过Protein Health模块的分析,用户可以轻松快速地发现蛋白质结构中不合理的区域。



4. DS 蛋白家族



通过分析某个蛋白质家族的蛋白质序列的保守模式以及三维结构中保守残基的位置,我们可以在分子水平上更好地理解蛋白质的功能机制。 Protein Families简单易用的流程还可以指导用户逐步进行分析,从蛋白质家族的序列或结构比较到进化轨迹分析。进化追踪分析包括使用层次聚类方法构建蛋白质家族树状图,并将获得的功能注释信息绘制到三维结构上。在进行序列比对时,可以根据需要对比对结果添加约束条件,以提高活性位点关键残基的比对效果。



5.DS序列分析



与其他具有已知功能的蛋白质的序列进行比较是确定蛋白质生物学功能的第一步。序列分析还允许用户通过常见的BLAST和PSI-BLAST算法搜索本地数据库或NCBI在线数据库,以确定蛋白质序列的同源区域。结果以交互式报告格式显示,方便进一步分析并在其他Discovery Studio破解版模块中使用。当使用Blast搜索PDB或PDB_nr95数据库时,结果文件中可以显示输出蛋白质的SCOP ID、配体ID和X射线分辨率。



指示



1.双击打开软件,如下图



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2.进入软件,显示很多示例文件。这里可以点击第一个Protein Structure来查看蛋白质结构。



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3、如图所示,这里是蛋白质的编辑样式。如果需要自己设计,可以从化学界面找到模型。



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4. 单击“多序列比对”功能来比对多个序列



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5. 关于DNA的一些子项目的提示。您可以点击DNA-Single Strand查看链接,还可以查看不同的分子样式。



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6. 点击Chemistry可查看软件的化学结构并分析立体化学模型。



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变更日志



1.新数据库有复制化学结构的计划。



2.可以从数据库中查找分子方程的变量数据



3.您也可以自己将实验结果制作成研究模板



4.还可以添加不同类型的化学元素



5.支持使用电解质方程插入模型



6.支持对分析的化学结果添加注释信息